Muv-Luv ATE全名为《Muv-Luv Alternative Total eclipse 》，全集动画片改编自《Muv-Luv Alternative》的外传小说。故事的时间设定在西元2001年，由于人类遭到地球外起源种(联合国称其为BETA)的侵略，正面临灭亡的危机，因此人类开始了先进战术机技术开发计划“XFJ计划”，各个国家均派遣了专门人员参与其中，该作讲述的就是这些被派遣过来的人员之间的故事。（有虫子吃掉妹纸情节,反差极大,请谨慎观看.）
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在与帝爱组会长兵藤和尊（津嘉山正種 配音）的对决中，伊藤开司（萩原聖人 配音）马失前蹄，欠下对方高达一千万日元的债务。由于无力偿还，开司被帝爱组投入地下的设施内进行强制劳动。在接下来的15年里，他将毫无希望地在这所人间地狱内工作直到还清所有帐务。而逃出这里的唯一希望就是那张“1日外出券”。地狱有地狱的法则，外出券需要付出相当大数额的代笔来获取。为了那一线希望，开司再次投入赌局之中。相比地上世界的赌坊，这里充满了更多的欲望、贪婪、诱惑以及罪恶。对开司来说，这无疑是一次刀尖上的舞蹈……本片根据日本漫画家福本伸行的原著改编。
高中三年级的冬天。高中生活剩下的时间已经不多。这样下去总有一天会迎来毕业，任谁都是这么想的。
与温柔友人们度过的，值得珍惜的每一天—— 美丽而虚幻的，人与妖的物语。 从小就能看见妖怪的少年·夏目贵志，继承了祖母玲子的遗产“友人帐”，与自称保镖的猫咪老师一起，开始将名字返还给被束缚在友人帐中的妖怪。 通过与妖怪及与之相关的人们接触，开始摸索自己前进之路的夏目，在与心灵相通的朋友们帮助下，设法守护自己重要的每一天。
劳尔（河本启佑 配音）自小就立志成为一名勇者，并且为了实现理想而付出了大量的努力和汗水，尽管周围的人都将劳尔看作是胡言乱语的怪人，但这并没有阻止劳尔追逐梦想的脚步。然而，就在他即将取得勇者测验合格证的前夕，竟然出来了魔王被打倒的消息，勇者制度亦因此被废除，这也就意味着，勇者劳尔，失业了。身心都遭受了巨大打击的劳尔变成了家里蹲，并在汹涌而来的就业潮中好不容易得到了在魔术店莱昂王都店打工的职位。让劳尔没有想到的是，一位名为菲诺（田所梓 配音）的女孩成为了她的同事，而菲诺的正是身份，竟然是魔王的女儿。
邻座的女孩忘记戴眼镜了。
描述主角灯荒仁在机缘巧合下，碰到了过去的好友浅观音真宝，但却因此卷入了一场强者间斗争的故事。
当发现皇帝最宠爱的妃子玉波公主怀孕时，猫猫重返玉宫，继续担任试毒师。他们整天警惕着，试图阻止针对皇后和皇帝孩子的事件再次发生。新贵妃柔然入宫，她的父亲是前任皇帝时代的一位高级藩王；一桩史无前例的悬案威胁着仁慈的生活；而嫌疑人翠玲却失踪了。就在气氛紧张之际，一支来自异国的商队，甚至还有提出无理要求的特使到来。宫殿之中，云雾开始变得更加阴暗。一个新的棘手案件等待着猫猫和仁史。这些事件最终都会发展成为涉及整个国家的大事件。
世界因僵尸大流行而崩溃。他保护了失去记忆并在陌生的地方醒来的美琴和住在这里的女友。
